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顯微成像·洞察微觀之美
Microscopic imaging, insight into the beauty of micro
數字切片掃描儀(yi) 怎麽(me) 選?
發布時間:2025-02-15
訪問量:126
怎麽(me) 選?
2024年5月,Nature發布了一篇重磅論文,微軟和華盛頓大學等機構共同推出了全球首個(ge) 全切片數字病理AI模型GigaPath ,具備十億(yi) 像素級別圖像的處理和理解能力,相當於(yu) 能理解40X 物鏡下掃描的數字切片。目前Prov-GigaPath的模型和代碼已經開源,部分科研機構已經開始自己製作數字切片文件,來進一步訓練GigaPath用於(yu) 各種生物醫學研究。那麽(me) 怎麽(me) 選呢?
一、數字切片
數字切片①
數字切片是用高分辨率物鏡將玻璃切片掃描、拚接形成的圖像文件,每張數字切片都有數億(yi) 像素,40X高分辨物鏡掃描的數字切片像素更可接近10億(yi) ,信息量非常大。
數字切片解決(jue) 方案:數字切片掃描儀(yi) MDS4
完整的數字切片解決(jue) 方案可以分四大功能板塊:
1、掃描:使用數字切片掃描儀(yi) 捕獲圖像數據。
2、儲(chu) 存:將圖像數據儲(chu) 存為(wei) 數字切片文件並歸檔管理。
3、處理:提供數字切片圖像旋轉、顏色調整等處理功能。
4、閱片:瀏覽數字切片文件,以及與(yu) 其他人分享切片文件。
可見,整個(ge) 數字切片解決(jue) 方案核心圍繞的是數字切片文件。
二、為(wei) 什麽(me) 要做數字切片?
相比傳(chuan) 統的玻璃樣品切片,數字切片有哪些優(you) 勢呢?
使用數字切片訓練AI識別不同細胞②
首先是AI模型訓練。AI模型輔助能大大提升工作效率,比如在癌症研究引入AI,可幫助加速識別癌症標記物和腫瘤分型等流程,但AI需要大量的數據訓練才能高效、準確,核心數據就是數字切片文件。
數字切片方便信息共享和合作
其次是信息共享及增強合作。玻璃玻片難以分享,MDS4的數字切片文件可以通過網絡分享,讓突破地域限製的分享成為(wei) 可能,網絡會(hui) 議、跨學科合作研究都會(hui) 受益。
稀有樣品掃成數字切片很有價(jia) 值(類戈謝細胞)
第三是保護珍貴樣品。製作精良的稀有樣品千金難求,有些珍貴樣品在老師手上也就僅(jin) 此一片,但玻片畢竟是易碎的玻璃,最怕不小心損壞。利用MDS4的數字切片文件,可以將樣品的最佳狀態和豐(feng) 富信息記錄下來。
三、怎麽(me) 選?
箱式數字切片掃描儀(yi) 僅(jin) 適合少數量大的用戶
箱式數字切片掃描儀(yi) 高價(jia) 且功能單一,不適合大部分用戶。從(cong) 大批量處理能力來說,箱式的搭配工作站電腦無疑是冠軍(jun) 方案。但這種方案的成本很高,除了少數大醫院和實驗室有足夠的量來保證能夠回本,其他大部分小醫療機構和科研單位根本回不了本,因為(wei) 他們(men) 平均每周的掃描量可能十個(ge) 手指就能數完。
普通顯微鏡做數字切片效果不理想
普通顯微鏡手動掃描拚接效果不理想,不適合嚴(yan) 肅應用。手動掃描拚接隻需數字攝像頭和軟件搭配即可實現,成本夠低,但效果較差,比如玻片中間有空白就會(hui) 掃描不下去,又比如樣品不平整導致局部失焦模糊,還有光照不均勻、物鏡平場性不佳導致拚接痕跡明顯。最後就算掃描很順利,掃出來的幾億(yi) 像素文件也會(hui) 讓瀏覽切片變成災難。
數字切片掃描儀(yi) MDS4有更高投入產(chan) 出比
明美MDS4是更符合大部分單位需要的數字切片掃描儀(yi) 器。MDS4既是研究級熒光顯微鏡,又是數字切片掃描儀(yi) ,一機兩(liang) 用,有媲美箱式掃描儀(yi) 的掃描速度和精度,也有專(zhuan) 業(ye) 的儲(chu) 存格式和閱片軟件,投入產(chan) 出比更高。
MDS4可作為(wei) 電動研究級熒光顯微鏡使用
明美MDS4以一機兩(liang) 用為(wei) 設計理念,適合大部份單位的投入產(chan) 出目標。
1、基於(yu) 研究級熒光顯微鏡,可用於(yu) FISH熒光原位雜交和免疫熒光觀察研究。
2、創新雙分光相機接口,同時滿足高幀率掃描和高分辨率單視野成像。
3、可作為(wei) 升級套件安裝到客戶現有的BX43/BX53等顯微鏡,更低投入實現掃描功能,不影響原有顯微鏡功能。
性能媲美箱式數字切片掃描儀(yi)
明美MDS4基於(yu) 研究級熒光顯微鏡設計,可以實現媲美箱式掃描儀(yi) 的掃描速度和精度。
1、MDS4采用高精度XYZ三軸電動平台,閉環分辨率達0.1μm,掃描平穩精準低噪音,搭配峰值幀率100fps以上的掃描相機,全片掃描速度可低至40秒完成。
2、MDS4支持自動對焦掃描,遇到不平整區域可自動進行疊加景深,使整個(ge) 玻片所有視野都細節清晰。
3、MDS4軟件采用了硬件加速進行無縫拚接,因此無需工作站電腦也能快速出圖並儲(chu) 存成數字切片文件。
專(zhuan) 業(ye) 的配套軟件
MDS4配套Slide Scan掃描軟件和Slide Viewer閱片軟件,專(zhuan) 業(ye) 的儲(chu) 存格式和閱片軟件帶來良好的用戶體(ti) 驗。
1、MDS4軟件采用先進的SRP格式數據,占用空間比常見圖片格式更低,同時保留數億(yi) 像素豐(feng) 富信息。
2、MDS4閱片軟件提供豐(feng) 富的數字切片管理功能和處理功能,自動拍攝玻片標簽和數字切片一一對應,提供色彩調整等常用處理功能。
3、MDS4軟件廣泛使用硬件加速技術,閱片縮放和拖動瀏覽都十分順暢。
大部分單位每周的切片掃描量不到10片,一台能實現數字切片掃描功能的研究級顯微鏡,是更符合這些單位投入產(chan) 出目標的產(chan) 品,明美MDS4就是針對這些客戶設計的產(chan) 品,如果您有需要,歡迎致電明美了解谘詢。
應用文獻:
①Konstantinos Zormpas-Petridis1, Rosa Noguera, et al. SuperHistopath:A Deep Learning Pipeline for Mapping Tumor Heterogeneity on Low-Resolution Whole-Slide Digital Histopathology Images,Front. Oncol., 20 January 2021,Sec. Cancer Imaging and Image-directed Interventions,Volume 10 - 2020 | https://doi.org/10.3389/fonc.2020.586292
②Yannick Van Herck1, Asier Antoranz,et al. Multiplexed Immunohistochemistry and Digital Pathology as the Foundation for Next-Generation Pathology in Melanoma: Methodological Comparison and Future Clinical Applications, Front. Oncol., 29 March 2021, Sec. Skin Cancer, Volume 11 - 2021 | https://doi.org/10.3389/fonc.2021.636681
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